minor changes in header inclusions
[openjpeg.git] / mj2 / frames_to_mj2.c
index c1583777fe5df69ef8b0c2ecfa58d5e3d47b6937..6b1fd536a4589da120169f9f49c79424d1b5a12a 100644 (file)
 * POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
 */
 
-#include <openjpeg.h>
 #include <stdio.h>
 #include <stdlib.h>
-#include <math.h>
 #include <string.h>
-#ifndef DONT_HAVE_GETOPT
-#include <getopt.h>
-#else
-#include "compat/getopt.h"
-#endif
+
+#include "openjpeg.h"
+#include "../libopenjpeg/j2k_lib.h"
+#include "../libopenjpeg/j2k.h"
+#include "../libopenjpeg/jp2.h"
+#include "../libopenjpeg/cio.h"
+#include "mj2.h"
 #include "mj2_convert.h"
+#include "getopt.h"
+
+/**
+Size of memory first allocated for MOOV box
+*/
+#define TEMP_BUF 10000 
+
+/* -------------------------------------------------------------------------- */
+
+/**
+sample error callback expecting a FILE* client object
+*/
+void error_callback(const char *msg, void *client_data) {
+       FILE *stream = (FILE*)client_data;
+       fprintf(stream, "[ERROR] %s", msg);
+}
+/**
+sample warning callback expecting a FILE* client object
+*/
+void warning_callback(const char *msg, void *client_data) {
+       FILE *stream = (FILE*)client_data;
+       fprintf(stream, "[WARNING] %s", msg);
+}
+/**
+sample debug callback expecting a FILE* client object
+*/
+void info_callback(const char *msg, void *client_data) {
+       FILE *stream = (FILE*)client_data;
+       fprintf(stream, "[INFO] %s", msg);
+}
+
+/* -------------------------------------------------------------------------- */
+
 
 void help_display()
 {
-  printf("HELP\n----\n\n");
-  printf("- the option -help displays the readme.txt file on screen\n\n");
-
-
-  printf("List of parameters for the MJ2 coder :\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("- The markers COD and QCD are writed both of two in the main_header and never appear in the tile_header.  The markers in the main header are : SOC SIZ COD QCD COM.\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("- This coder can encode mega image, a test was made on a 24000x24000 pixels color image.  You need enough disk space memory (twice the original) to encode the image. (i.e. for a 1.5 Gb image you need a minimum of 3Gb of disk memory)\n");
-  printf("\n");
-  printf("REMARKS :\n");
-  printf("---------\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("* the value of rate enter in the code line is the compression factor !\n");
-  printf("exemple :\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-r 20,10,1 means quality 1 : compress 20x, quality 2 : compress 10x and quality 3 : compress 1x = lossless\n");
-  printf("\n");
-  printf("By default :\n");
-  printf("------------\n");
-  printf("\n");
-  printf(" * lossless\n");
-  printf(" * 1 tile\n");
-  printf(" * size of precinct 2^15 x 2^15 (means 1 precinct)\n");
-  printf(" * size of code-block 64 x 64\n");
-  printf(" * Number of resolution : 6\n");
-  printf(" * No SOP marker in the codestream\n");
-  printf(" * No EPH marker in the codestream\n");
-  printf(" * No sub-sampling in x and y direction\n");
-  printf(" * No mode switch activated\n");
-  printf(" * progression order : LRCP\n");
-  printf(" * No index file\n");
-  printf(" * No ROI upshifted\n");
-  printf(" * No offset of the origin of the image\n");
-  printf(" * No offset of the origin of the tiles\n");
-  printf(" * Reversible DWT 5-3\n");
-  printf("\n");
-  printf("Parameters :\n");
-  printf("------------\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-i             : source file  (-i source.pnm also *.pgm, *.ppm) required\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-o             : destination file (-o dest.j2k or .jp2) required\n");
-  printf("\n");
-  printf("-help          : Display the help information optional\n ");
-  printf("\n");
-  printf("-r             : different rates (-r 20,10,5) optional\n ");
-  printf("\n");
-  printf("-n             : Number of resolution (-n 3) optional\n");
-  printf("\n");
-  printf("-b             : size of code block (-b 32,32) optional\n");
-  printf("\n");
-  printf("-c             : size of precinct (-c 128,128) optional\n");
-  printf("\n");
-  printf("-t             : size of tile (-t 512,512) optional\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-p             : progression order (-p LRCP) [LRCP, RLCP, RPCL, PCRL, CPRL] optional\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-s             : subsampling factor (-s 2,2) [-s X,Y] optional\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-SOP           : write SOP marker before each packet optional\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-EPH           : write EPH marker after each header packet optional\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-M             : mode switch (-M 3) [1=BYPASS(LAZY) 2=RESET 4=RESTART(TERMALL) 8=VSC 16=ERTERM(SEGTERM) 32=SEGMARK(SEGSYM)] optional\n");
-  printf
-    ("                    for several mode switch you have to add the value of each mode you want\n");
-  printf
-    ("                    ex : RESTART(4) + RESET(2) + SEGMARK(32) = -M 38\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-x             : Create an index file *.Idx (-x index_name.Idx) optional\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-ROI:c=%%d,U=%%d : quantization indices upshifted for component c=%%d [%%d = 0,1,2]\n");
-  printf
-    ("                 with a value of U=%%d [0 <= %%d <= 37] (i.e. -ROI:c=0,U=25) optional\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-d             : offset of the origin of the image (-d 150,300) optional\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-T             : offset of the origin of the tiles (-T 100,75) optional\n");
-  printf("\n");
-  printf("-I             : Use the irreversible DWT 9-7 (-I) optional\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-W             : Specify image width, height and the dx and dy subsampling of the Cb and Cr components for YUV files (default 352x288 and 420 Cif format)\n");
-  printf("\n");
-  printf
-    ("-F             : Specify video frame rate (set to 25 by default)\n");
-  printf("\n");
-  printf("IMPORTANT :\n");
-  printf("-----------\n");
-  printf("\n");
-  printf("* subsampling bigger than 2 can produce error\n");
-  printf("\n");
-  printf("The index file respect the structure below :\n");
-  printf("---------------------------------------------\n");
-  printf("\n");
-  printf("Image_height Image_width\n");
-  printf("progression order\n");
-  printf("Tiles_size_X Tiles_size_Y\n");
-  printf("Components_nb\n");
-  printf("Layers_nb\n");
-  printf("decomposition_levels\n");
-  printf("Precincts_size_X Precincts_size_Y\n");
-  printf("Main_header_end_position\n");
-  printf("Codestream_size\n");
-  printf("Tile0 start_pos end_Theader end_pos\n");
-  printf("Tile1  ''           ''        ''\n");
-  printf("...\n");
-  printf("TileN  ''           ''        ''\n");
-  printf("Tpacket_0 Tile layer res. comp. prec. start_pos end_pos\n");
-  printf("...\n");
-  printf("Tpacket_M  ''    ''   ''   ''    ''       ''       ''\n");
+  fprintf(stdout,"HELP for frames_to_mj2\n----\n\n");
+  fprintf(stdout,"- the -h option displays this help information on screen\n\n");
+  
+  
+  fprintf(stdout,"List of parameters for the MJ2 encoder:\n");
+  fprintf(stdout,"\n");
+  fprintf(stdout,"REMARKS:\n");
+  fprintf(stdout,"---------\n");
+  fprintf(stdout,"\n");
+  fprintf
+    (stdout,"The markers written to the main_header are : SOC SIZ COD QCD COM.\n");
+  fprintf
+    (stdout,"COD and QCD never appear in the tile_header.\n");
+  fprintf(stdout,"\n");
+  fprintf(stdout,"By default:\n");
+  fprintf(stdout,"------------\n");
+  fprintf(stdout,"\n");
+  fprintf(stdout," * Lossless\n");
+  fprintf(stdout," * 1 tile\n");
+  fprintf(stdout," * Size of precinct : 2^15 x 2^15 (means 1 precinct)\n");
+  fprintf(stdout," * Size of code-block : 64 x 64\n");
+  fprintf(stdout," * Number of resolutions: 6\n");
+  fprintf(stdout," * No SOP marker in the codestream\n");
+  fprintf(stdout," * No EPH marker in the codestream\n");
+  fprintf(stdout," * No sub-sampling in x or y direction\n");
+  fprintf(stdout," * No mode switch activated\n");
+  fprintf(stdout," * Progression order: LRCP\n");
+  fprintf(stdout," * No index file\n");
+  fprintf(stdout," * No ROI upshifted\n");
+  fprintf(stdout," * No offset of the origin of the image\n");
+  fprintf(stdout," * No offset of the origin of the tiles\n");
+  fprintf(stdout," * Reversible DWT 5-3\n");
+  fprintf(stdout,"\n");
+  fprintf(stdout,"Parameters:\n");
+  fprintf(stdout,"------------\n");
+  fprintf(stdout,"\n");
+  fprintf
+    (stdout,"Required Parameters (except with -h):\n");
+  fprintf
+    (stdout,"-i           : source file  (-i source.yuv) \n");
+  fprintf
+    (stdout,"-o           : destination file (-o dest.mj2) \n");
+  fprintf
+    (stdout,"Optional Parameters:\n");
+  fprintf(stdout,"-h           : display the help information \n");
+  fprintf(stdout,"-r           : different compression ratios for successive layers (-r 20,10,5)\n ");
+  fprintf(stdout,"              - The rate specified for each quality level is the desired \n");
+  fprintf(stdout,"                compression factor.\n");
+  fprintf(stdout,"                Example: -r 20,10,1 means quality 1: compress 20x, \n");
+  fprintf(stdout,"                  quality 2: compress 10x and quality 3: compress lossless\n");
+  fprintf(stdout,"               (options -r and -q cannot be used together)\n ");
+  
+  fprintf(stdout,"-q           : different psnr for successive layers (-q 30,40,50) \n ");
+  
+  fprintf(stdout,"               (options -r and -q cannot be used together)\n ");
+  
+  fprintf(stdout,"-n           : number of resolutions (-n 3) \n");
+  fprintf(stdout,"-b           : size of code block (-b 32,32) \n");
+  fprintf(stdout,"-c           : size of precinct (-c 128,128) \n");
+  fprintf(stdout,"-t           : size of tile (-t 512,512) \n");
+  fprintf
+    (stdout,"-p           : progression order (-p LRCP) [LRCP, RLCP, RPCL, PCRL, CPRL] \n");
+  fprintf
+    (stdout,"-s           : subsampling factor (-s 2,2) [-s X,Y] \n");
+  fprintf(stdout,"          Remark: subsampling bigger than 2 can produce error\n");
+  fprintf
+    (stdout,"-SOP         : write SOP marker before each packet \n");
+  fprintf
+    (stdout,"-EPH         : write EPH marker after each header packet \n");
+  fprintf
+    (stdout,"-M           : mode switch (-M 3) [1=BYPASS(LAZY) 2=RESET 4=RESTART(TERMALL)\n");
+  fprintf
+    (stdout,"                 8=VSC 16=ERTERM(SEGTERM) 32=SEGMARK(SEGSYM)] \n");
+  fprintf
+    (stdout,"                 Indicate multiple modes by adding their values. \n");
+  fprintf
+    (stdout,"                 ex: RESTART(4) + RESET(2) + SEGMARK(32) = -M 38\n");
+  fprintf
+    (stdout,"-ROI         : c=%%d,U=%%d : quantization indices upshifted \n");
+  fprintf
+    (stdout,"               for component c=%%d [%%d = 0,1,2]\n");
+  fprintf
+    (stdout,"               with a value of U=%%d [0 <= %%d <= 37] (i.e. -ROI:c=0,U=25) \n");
+  fprintf
+    (stdout,"-d           : offset of the origin of the image (-d 150,300) \n");
+  fprintf
+    (stdout,"-T           : offset of the origin of the tiles (-T 100,75) \n");
+  fprintf(stdout,"-I           : use the irreversible DWT 9-7 (-I) \n");
+  fprintf(stdout,"-W           : image width, height and the dx and dy subsampling \n");
+  fprintf(stdout,"               of the Cb and Cr components for YUV files \n");
+  fprintf(stdout,"               (default is '352,288,2,2' for CIF format's 352x288 and 4:2:0)\n");
+  fprintf(stdout,"-F           : video frame rate (set to 25 by default)\n");
+  
+  fprintf(stdout,"\n");
+  fprintf(stdout,"IMPORTANT:\n");
+  fprintf(stdout,"-----------\n");
+  fprintf(stdout,"\n");
+  fprintf(stdout,"The index file has the structure below:\n");
+  fprintf(stdout,"---------------------------------------\n");
+  fprintf(stdout,"\n");
+  fprintf(stdout,"Image_height Image_width\n");
+  fprintf(stdout,"progression order\n");
+  fprintf(stdout,"Tiles_size_X Tiles_size_Y\n");
+  fprintf(stdout,"Components_nb\n");
+  fprintf(stdout,"Layers_nb\n");
+  fprintf(stdout,"decomposition_levels\n");
+  fprintf(stdout,"[Precincts_size_X_res_Nr Precincts_size_Y_res_Nr]...\n");
+  fprintf(stdout,"   [Precincts_size_X_res_0 Precincts_size_Y_res_0]\n");
+  fprintf(stdout,"Main_header_end_position\n");
+  fprintf(stdout,"Codestream_size\n");
+  fprintf(stdout,"Tile_0 start_pos end_Theader end_pos TotalDisto NumPix MaxMSE\n");
+  fprintf(stdout,"Tile_1   ''           ''        ''        ''       ''    ''\n");
+  fprintf(stdout,"...\n");
+  fprintf(stdout,"Tile_Nt   ''           ''        ''        ''       ''    ''\n");
+  fprintf(stdout,"Tpacket_0 Tile layer res. comp. prec. start_pos end_pos disto\n");
+  fprintf(stdout,"...\n");
+  fprintf(stdout,"Tpacket_Np ''   ''    ''   ''    ''       ''       ''     ''\n");
+  
+  fprintf(stdout,"MaxDisto\n");
+  
+  fprintf(stdout,"TotalDisto\n\n");
 }
 
 int give_progression(char progression[4])
 {
   if (progression[0] == 'L' && progression[1] == 'R'
-      && progression[2] == 'C' && progression[3] == 'P') {
+    && progression[2] == 'C' && progression[3] == 'P') {
     return 0;
   } else {
     if (progression[0] == 'R' && progression[1] == 'L'
-       && progression[2] == 'C' && progression[3] == 'P') {
+      && progression[2] == 'C' && progression[3] == 'P') {
       return 1;
     } else {
       if (progression[0] == 'R' && progression[1] == 'P'
-         && progression[2] == 'C' && progression[3] == 'L') {
-       return 2;
+                               && progression[2] == 'C' && progression[3] == 'L') {
+                               return 2;
       } else {
-       if (progression[0] == 'P' && progression[1] == 'C'
-           && progression[2] == 'R' && progression[3] == 'L') {
-         return 3;
-       } else {
-         if (progression[0] == 'C' && progression[1] == 'P'
-             && progression[2] == 'R' && progression[3] == 'L') {
-           return 4;
-         } else {
-           return -1;
-         }
-       }
+                               if (progression[0] == 'P' && progression[1] == 'C'
+                                       && progression[2] == 'R' && progression[3] == 'L') {
+                                       return 3;
+                               } else {
+                                       if (progression[0] == 'C' && progression[1] == 'P'
+                                               && progression[2] == 'R' && progression[3] == 'L') {
+                                               return 4;
+                                       } else {
+                                               return -1;
+                                       }
+                               }
       }
     }
   }
 }
 
-double dwt_norms_97[4][10] = {
-  {1.000, 1.965, 4.177, 8.403, 16.90, 33.84, 67.69, 135.3, 270.6, 540.9},
-  {2.022, 3.989, 8.355, 17.04, 34.27, 68.63, 137.3, 274.6, 549.0},
-  {2.022, 3.989, 8.355, 17.04, 34.27, 68.63, 137.3, 274.6, 549.0},
-  {2.080, 3.865, 8.307, 17.18, 34.71, 69.59, 139.3, 278.6, 557.2}
-};
 
-int floorlog2(int a)
-{
-  int l;
-  for (l = 0; a > 1; l++) {
-    a >>= 1;
-  }
-  return l;
-}
-
-void encode_stepsize(int stepsize, int numbps, int *expn, int *mant)
-{
-  int p, n;
-  p = floorlog2(stepsize) - 13;
-  n = 11 - floorlog2(stepsize);
-  *mant = (n < 0 ? stepsize >> -n : stepsize << n) & 0x7ff;
-  *expn = numbps - p;
-}
 
-void calc_explicit_stepsizes(j2k_tccp_t * tccp, int prec)
-{
-  int numbands, bandno;
-  numbands = 3 * tccp->numresolutions - 2;
-  for (bandno = 0; bandno < numbands; bandno++) {
-    double stepsize;
-
-    int resno, level, orient, gain;
-    resno = bandno == 0 ? 0 : (bandno - 1) / 3 + 1;
-    orient = bandno == 0 ? 0 : (bandno - 1) % 3 + 1;
-    level = tccp->numresolutions - 1 - resno;
-    gain =
-      tccp->qmfbid == 0 ? 0 : (orient ==
-                              0 ? 0 : (orient == 1
-                                       || orient == 2 ? 1 : 2));
-    if (tccp->qntsty == J2K_CCP_QNTSTY_NOQNT) {
-      stepsize = 1.0;
-    } else {
-      double norm = dwt_norms_97[orient][level];
-      stepsize = (1 << (gain + 1)) / norm;
-    }
-    encode_stepsize((int) floor(stepsize * 8192.0), prec + gain,
-                   &tccp->stepsizes[bandno].expn,
-                   &tccp->stepsizes[bandno].mant);
-  }
-}
 
 int main(int argc, char **argv)
 {
-  int NumResolution, numD_min; /*   NumResolution : number of resolution                     */
-  int Tile_arg;                        /*   Tile_arg = 0 (not in argument) ou = 1 (in argument)      */
-  int CSty;                    /*   CSty : coding style                                      */
-  int Prog_order;              /*   progression order (default LRCP)                         */
-  char progression[4];
-  int numpocs, numpocs_tile;   /*   Number of progression order change (POC) default 0       */
-  int prcw_init[J2K_MAXRLVLS]; /*   Initialisation Precinct width                            */
-  int prch_init[J2K_MAXRLVLS]; /*   Initialisation Precinct height                           */
-  //int prcw_init, prch_init;                     /*   Initialisation precincts' size                           */
-  int cblockw_init, cblockh_init;      /*   Initialisation codeblocks' size                          */
-  int mode, value;             /*   Mode switch (cblk_style)                                 */
-  int subsampling_dx, subsampling_dy;  /* subsampling value for dx and dy                    */
-  int ROI_compno, ROI_shift;   /*   region of interrest                                      */
-  int Dim[2];                  /*   portion of the image coded                               */
-  int TX0, TY0;                        /*   tile off-set                                             */
-  mj2_movie_t movie;
-  j2k_cp_t cp, cp_init;                /*   cp_init is used to initialise in multiple tiles          */
-  j2k_tcp_t *tcp, *tcp_init;   /*   tcp_init is used to initialise in multiple tile          */
-  j2k_poc_t POC[32];           /*   POC : used in case of Progression order change           */
-  j2k_poc_t *tcp_poc;
-  j2k_tccp_t *tccp;
-  int i, tileno, j;
-  char *infile = 0;
-  char *outfile = 0;
-  char *index = 0;
+       mj2_cparameters_t mj2_parameters;       /* MJ2 compression parameters */
+       opj_cparameters_t *j2k_parameters;      /* J2K compression parameters */
+       opj_event_mgr_t event_mgr;              /* event manager */
+       opj_cio_t *cio;
+       int value;
+  opj_mj2_t *movie;
+       opj_image_t *img;
+  int i, j;
   char *s, S1, S2, S3;
-  int ir = 0;
-  int res_spec = 0;            /*   For various precinct sizes specification                 */
-  char sep;
-  int w;                       /*   Width of YUV file                                        */
-  int h;                       /*   Height of YUV file                                       */
-  int CbCr_subsampling_dx;     /*   Sample rate of YUV 4:4:4 4:2:2 or 4:2:0                  */
-  int CbCr_subsampling_dy;     /*   Sample rate of YUV 4:4:4 4:2:2 or 4:2:0                  */
-  int output_image_type = -1;
-  int frame_rate;              /*   Video Frame Rate                                         */
-  int numcomps;                        /*   In YUV files, numcomps always considered as 3            */
-  int prec;                    /*   In YUV files, precision always considered as 8           */
-  int x1, y1;
-
+  unsigned char *buf;
+  int x1, y1,  len;
+  long mdat_initpos, offset;
+  FILE *mj2file;
+  int sampleno;  
+       opj_cinfo_t* cinfo;
+  bool bSuccess;
+       int numframes;
+       double total_time = 0;  
 
   /* default value */
   /* ------------- */
-  NumResolution = 6;
-  CSty = 0;
-  cblockw_init = 64;
-  cblockh_init = 64;
-  cp.tw = 1;
-  cp.th = 1;
-  cp.index_on = 0;
-  Prog_order = 0;
-  numpocs = 0;
-  mode = 0;
-  subsampling_dx = 1;
-  subsampling_dy = 1;
-  ROI_compno = -1;             /* no ROI */
-  ROI_shift = 0;
-  Dim[0] = 0;
-  Dim[1] = 0;
-  TX0 = 0;
-  TY0 = 0;
-  cp.comment = NULL;
-  cp.disto_alloc = 0;
-  cp.fixed_alloc = 0;
-  cp.fixed_quality = 0;                //add fixed_quality
-  w = 352;                     // CIF default value
-  h = 288;                     // CIF default value
-  CbCr_subsampling_dx = 2;     // CIF default value
-  CbCr_subsampling_dy = 2;     // CIF default value
-  frame_rate = 25;
-
-
-  Tile_arg = 0;
-  cp_init.tcps = (j2k_tcp_t *) malloc(sizeof(j2k_tcp_t));      /* initialisation if only one tile */
-  tcp_init = &cp_init.tcps[0];
-  tcp_init->numlayers = 0;
-
-  cp.intermed_file = 0;                // Don't store each tile in a file during processing 
+  mj2_parameters.Dim[0] = 0;
+  mj2_parameters.Dim[1] = 0;
+  mj2_parameters.w = 352;                      // CIF default value
+  mj2_parameters.h = 288;                      // CIF default value
+  mj2_parameters.CbCr_subsampling_dx = 2;      // CIF default value
+  mj2_parameters.CbCr_subsampling_dy = 2;      // CIF default value
+  mj2_parameters.frame_rate = 25;        
+       /*
+       configure the event callbacks (not required)
+       setting of each callback is optionnal
+       */
+       memset(&event_mgr, 0, sizeof(opj_event_mgr_t));
+       event_mgr.error_handler = error_callback;
+       event_mgr.warning_handler = warning_callback;
+       event_mgr.info_handler = NULL;
+    
+       /* set J2K encoding parameters to default values */
+       opj_set_default_encoder_parameters(&mj2_parameters.j2k_parameters);
+       j2k_parameters = &mj2_parameters.j2k_parameters;
+
+       /* Create comment for codestream */
+       if(j2k_parameters->cp_comment == NULL) {
+    const char comment[] = "Created by OpenJPEG version ";
+               const size_t clen = strlen(comment);
+    const char *version = opj_version();
+               j2k_parameters->cp_comment = (char*)malloc(clen+strlen(version)+1);
+               sprintf(j2k_parameters->cp_comment,"%s%s", comment, version);
+       }
+
+       mj2_parameters.decod_format = 0;
+       mj2_parameters.cod_format = 0;
 
   while (1) {
     int c = getopt(argc, argv,
-                  "i:o:r:q:f:t:n:c:b:x:p:s:d:h:P:S:E:M:R:T:C:I:W:F");
+      "i:o:r:q:f:t:n:c:b:p:s:d:P:S:E:M:R:T:C:I:W:F:h");
     if (c == -1)
       break;
     switch (c) {
     case 'i':                  /* IN fill */
-      infile = optarg;
-      s = optarg;
-      while (*s) {
-       s++;
-      }
-      s--;
-      S3 = *s;
-      s--;
-      S2 = *s;
-      s--;
-      S1 = *s;
-
-      if ((S1 == 'y' && S2 == 'u' && S3 == 'v')
-         || (S1 == 'Y' && S2 == 'U' && S3 == 'V')) {
-       cp.image_type = 3;
-       break;
-      }
-      fprintf(stderr,
-             "!! Unrecognized format for infile : %c%c%c [accept only *.yuv] !!\n\n",
-             S1, S2, S3);
-      return 1;
+                       {
+                               char *infile = optarg;
+                               s = optarg;
+                               while (*s) {
+                                       s++;
+                               }
+                               s--;
+                               S3 = *s;
+                               s--;
+                               S2 = *s;
+                               s--;
+                               S1 = *s;
+                               
+                               if ((S1 == 'y' && S2 == 'u' && S3 == 'v')
+                                       || (S1 == 'Y' && S2 == 'U' && S3 == 'V')) {
+                                       mj2_parameters.decod_format = YUV_DFMT;                         
+                               }
+                               else {
+                                       fprintf(stderr,
+                                               "!! Unrecognized format for infile : %c%c%c [accept only *.yuv] !!\n\n",
+                                               S1, S2, S3);
+                                       return 1;
+                               }
+                               strncpy(mj2_parameters.infile, infile, sizeof(mj2_parameters.infile)-1);
+                       }
       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'o':                  /* OUT fill */
-      outfile = optarg;
-      while (*outfile) {
-       outfile++;
-      }
-      outfile--;
-      S3 = *outfile;
-      outfile--;
-      S2 = *outfile;
-      outfile--;
-      S1 = *outfile;
-
-      outfile = optarg;
-
-      if ((S1 == 'm' && S2 == 'j' && S3 == '2')
-         || (S1 == 'M' && S2 == 'J' && S3 == '2'))
-       cp.JPEG2000_format = 2;
-      else {
-       fprintf(stderr,
-               "Unknown output format image *.%c%c%c [only *.mj2]!! \n",
-               S1, S2, S3);
-       return 1;
+                       {
+                               char *outfile = optarg;
+                               while (*outfile) {
+                                       outfile++;
+                               }
+                               outfile--;
+                               S3 = *outfile;
+                               outfile--;
+                               S2 = *outfile;
+                               outfile--;
+                               S1 = *outfile;
+                               
+                               outfile = optarg;
+                               
+                               if ((S1 == 'm' && S2 == 'j' && S3 == '2')
+                                       || (S1 == 'M' && S2 == 'J' && S3 == '2'))
+                                       mj2_parameters.cod_format = MJ2_CFMT;
+                               else {
+                                       fprintf(stderr,
+                                               "Unknown output format image *.%c%c%c [only *.mj2]!! \n",
+                                               S1, S2, S3);
+                                       return 1;
+                               }
+                               strncpy(mj2_parameters.outfile, outfile, sizeof(mj2_parameters.outfile)-1);      
       }
-
-
-
       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'r':                  /* rates rates/distorsion */
-      s = optarg;
-      while (sscanf(s, "%d", &tcp_init->rates[tcp_init->numlayers])
-            == 1) {
-       tcp_init->numlayers++;
-       while (*s && *s != ',') {
-         s++;
-       }
-       if (!*s)
-         break;
-       s++;
-      }
-      cp.disto_alloc = 1;
-      cp.matrice = NULL;
+                       {
+                               float rate;
+                               s = optarg;
+                               while (sscanf(s, "%f", &rate) == 1) {
+                                       j2k_parameters->tcp_rates[j2k_parameters->tcp_numlayers] = rate * 2;
+                                       j2k_parameters->tcp_numlayers++;
+                                       while (*s && *s != ',') {
+                                               s++;
+                                       }
+                                       if (!*s)
+                                               break;
+                                       s++;
+                               }
+                               j2k_parameters->cp_disto_alloc = 1;
+                       }
       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'q':                  /* add fixed_quality */
       s = optarg;
-      while (sscanf
-            (s, "%f", &tcp_init->distoratio[tcp_init->numlayers]) == 1) {
-       tcp_init->numlayers++;
-       while (*s && *s != ',') {
-         s++;
-       }
-       if (!*s)
-         break;
-       s++;
-      }
-      cp.fixed_quality = 1;
-      cp.matrice = NULL;
+                       while (sscanf(s, "%f", &j2k_parameters->tcp_distoratio[j2k_parameters->tcp_numlayers]) == 1) {
+                               j2k_parameters->tcp_numlayers++;
+                               while (*s && *s != ',') {
+                                       s++;
+                               }
+                               if (!*s)
+                                       break;
+                               s++;
+                       }
+                       j2k_parameters->cp_fixed_quality = 1;
       break;
       /* dda */
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'f':                  /* mod fixed_quality (before : -q) */
-      s = optarg;
-      sscanf(s, "%d", &tcp_init->numlayers);
-      s++;
-      if (tcp_init->numlayers > 9)
-       s++;
-      cp.matrice =
-       (int *) malloc(tcp_init->numlayers * NumResolution * 3 *
-                      sizeof(int));
-      s = s + 2;
-      for (i = 0; i < tcp_init->numlayers; i++) {
-       tcp_init->rates[i] = 1;
-       sscanf(s, "%d,", &cp.matrice[i * NumResolution * 3]);
-       s += 2;
-       if (cp.matrice[i * NumResolution * 3] > 9)
-         s++;
-       cp.matrice[i * NumResolution * 3 + 1] = 0;
-       cp.matrice[i * NumResolution * 3 + 2] = 0;
-       for (j = 1; j < NumResolution; j++) {
-         sscanf(s, "%d,%d,%d",
-                &cp.matrice[i * NumResolution * 3 + j * 3 + 0],
-                &cp.matrice[i * NumResolution * 3 + j * 3 + 1],
-                &cp.matrice[i * NumResolution * 3 + j * 3 + 2]);
-         s += 6;
-         if (cp.matrice[i * NumResolution * 3 + j * 3] > 9)
-           s++;
-         if (cp.matrice[i * NumResolution * 3 + j * 3 + 1] > 9)
-           s++;
-         if (cp.matrice[i * NumResolution * 3 + j * 3 + 2] > 9)
-           s++;
-       }
-       if (i < tcp_init->numlayers - 1)
-         s++;
-      }
-      cp.fixed_alloc = 1;
-      break;
+                       {
+                               int *row = NULL, *col = NULL;
+                               int numlayers = 0, numresolution = 0, matrix_width = 0;
+                               
+                               s = optarg;
+                               sscanf(s, "%d", &numlayers);
+                               s++;
+                               if (numlayers > 9)
+                                       s++;
+                               
+                               j2k_parameters->tcp_numlayers = numlayers;
+                               numresolution = j2k_parameters->numresolution;
+                               matrix_width = numresolution * 3;
+                               j2k_parameters->cp_matrice = (int *) malloc(numlayers * matrix_width * sizeof(int));
+                               s = s + 2;
+                               
+                               for (i = 0; i < numlayers; i++) {
+                                       row = &j2k_parameters->cp_matrice[i * matrix_width];
+                                       col = row;
+                                       j2k_parameters->tcp_rates[i] = 1;
+                                       sscanf(s, "%d,", &col[0]);
+                                       s += 2;
+                                       if (col[0] > 9)
+                                               s++;
+                                       col[1] = 0;
+                                       col[2] = 0;
+                                       for (j = 1; j < numresolution; j++) {
+                                               col += 3;
+                                               sscanf(s, "%d,%d,%d", &col[0], &col[1], &col[2]);
+                                               s += 6;
+                                               if (col[0] > 9)
+                                                       s++;
+                                               if (col[1] > 9)
+                                                       s++;
+                                               if (col[2] > 9)
+                                                       s++;
+                                       }
+                                       if (i < numlayers - 1)
+                                               s++;
+                               }
+                               j2k_parameters->cp_fixed_alloc = 1;
+                       }
+                       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 't':                  /* tiles */
-      sscanf(optarg, "%d,%d", &cp.tdx, &cp.tdy);
-      Tile_arg = 1;
+      sscanf(optarg, "%d,%d", &j2k_parameters->cp_tdx, &j2k_parameters->cp_tdy);
+                       j2k_parameters->tile_size_on = true;
       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'n':                  /* resolution */
-      sscanf(optarg, "%d", &NumResolution);
+      sscanf(optarg, "%d", &j2k_parameters->numresolution);
       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'c':                  /* precinct dimension */
-      s = optarg;
-      do {
-       sep = 0;
-       sscanf(s, "[%d,%d]%c", &prcw_init[res_spec],
-              &prch_init[res_spec], &sep);
-       CSty |= 0x01;
-       res_spec++;
-       s = strpbrk(s, "]") + 2;
-      } while (sep == ',');
-      break;
+                       {
+                               char sep;
+                               int res_spec = 0;
+
+                               char *s = optarg;
+                               do {
+                                       sep = 0;
+                                       sscanf(s, "[%d,%d]%c", &j2k_parameters->prcw_init[res_spec],
+                                 &j2k_parameters->prch_init[res_spec], &sep);
+                                       j2k_parameters->csty |= 0x01;
+                                       res_spec++;
+                                       s = strpbrk(s, "]") + 2;
+                               }
+                               while (sep == ',');
+                               j2k_parameters->res_spec = res_spec;
+                       }
+                       break;
+
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'b':                  /* code-block dimension */
-      sscanf(optarg, "%d,%d", &cblockw_init, &cblockh_init);
-      if (cblockw_init * cblockh_init > 4096 || cblockw_init > 1024
-         || cblockw_init < 4 || cblockh_init > 1024 || cblockh_init < 4) {
-       fprintf(stderr,
-               "!! Size of code_block error (option -b) !!\n\nRestriction :\n    * width*height<=4096\n    * 4<=width,height<= 1024\n\n");
-       return 1;
-      }
-      break;
-      /* ----------------------------------------------------- */
-    case 'x':                  /* creation of index file */
-      index = optarg;
-      cp.index_on = 1;
-      break;
+                       {
+                               int cblockw_init = 0, cblockh_init = 0;
+                               sscanf(optarg, "%d,%d", &cblockw_init, &cblockh_init);
+                               if (cblockw_init * cblockh_init > 4096 || cblockw_init > 1024
+                                       || cblockw_init < 4 || cblockh_init > 1024 || cblockh_init < 4) {
+                                       fprintf(stderr,
+                                               "!! Size of code_block error (option -b) !!\n\nRestriction :\n"
+            "    * width*height<=4096\n    * 4<=width,height<= 1024\n\n");
+                                       return 1;
+                               }
+                               j2k_parameters->cblockw_init = cblockw_init;
+                               j2k_parameters->cblockh_init = cblockh_init;
+                       }
+                       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'p':                  /* progression order */
-      s = optarg;
-      for (i = 0; i < 4; i++) {
-       progression[i] = *s;
-       s++;
-      }
-      Prog_order = give_progression(progression);
-
-      if (Prog_order == -1) {
-       fprintf(stderr,
-               "Unrecognized progression order [LRCP, RLCP, RPCL, PCRL, CPRL] !!\n");
-       return 1;
-      }
-      break;
+                       {
+                               char progression[4];
+                               
+                               strncpy(progression, optarg, 4);
+                               j2k_parameters->prog_order = give_progression(progression);
+                               if (j2k_parameters->prog_order == -1) {
+                                       fprintf(stderr, "Unrecognized progression order "
+            "[LRCP, RLCP, RPCL, PCRL, CPRL] !!\n");
+                                       return 1;
+                               }
+                       }
+                       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 's':                  /* subsampling factor */
-      if (sscanf(optarg, "%d,%d", &subsampling_dx, &subsampling_dy)
-         != 2) {
-       fprintf(stderr,
-               "'-s' sub-sampling argument error !  [-s dx,dy]\n");
-       return 1;
-      }
-      break;
+      {
+                               if (sscanf(optarg, "%d,%d", &j2k_parameters->subsampling_dx,
+                                    &j2k_parameters->subsampling_dy) != 2) {
+                                       fprintf(stderr, "'-s' sub-sampling argument error !  [-s dx,dy]\n");
+                                       return 1;
+                               }
+                       }
+                       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'd':                  /* coordonnate of the reference grid */
-      if (sscanf(optarg, "%d,%d", &Dim[0], &Dim[1]) != 2) {
-       fprintf(stderr,
-               "-d 'coordonnate of the reference grid' argument error !! [-d x0,y0]\n");
-       return 1;
-      }
-      break;
+      {
+                               if (sscanf(optarg, "%d,%d", &j2k_parameters->image_offset_x0,
+                                    &j2k_parameters->image_offset_y0) != 2) {
+                                       fprintf(stderr, "-d 'coordonnate of the reference grid' argument "
+            "error !! [-d x0,y0]\n");
+                                       return 1;
+                               }
+                       }
+                       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'h':                  /* Display an help description */
       help_display();
@@ -532,80 +509,96 @@ int main(int argc, char **argv)
       break;
       /* ----------------------------------------------------- */
     case 'P':                  /* POC */
-      fprintf(stderr, "/----------------------------------\\\n");
-      fprintf(stderr, "|  POC option not fully tested !!  |\n");
-      fprintf(stderr, "\\----------------------------------/\n");
-
-      s = optarg;
-      while (sscanf(s, "T%d=%d,%d,%d,%d,%d,%s", &POC[numpocs].tile,
-                   &POC[numpocs].resno0, &POC[numpocs].compno0,
-                   &POC[numpocs].layno1, &POC[numpocs].resno1,
-                   &POC[numpocs].compno1, POC[numpocs].progorder) == 7) {
-       POC[numpocs].prg = give_progression(POC[numpocs].progorder);
-       /* POC[numpocs].tile; */
-       numpocs++;
-       while (*s && *s != '/') {
-         s++;
-       }
-       if (!*s)
-         break;
-       s++;
-      }
-      break;
+      {
+                               int numpocs = 0;                /* number of progression order change (POC) default 0 */
+                               opj_poc_t *POC = NULL;  /* POC : used in case of Progression order change */
+
+                               char *s = optarg;
+                               POC = j2k_parameters->POC;
+
+                               while (sscanf(s, "T%d=%d,%d,%d,%d,%d,%4s", &POC[numpocs].tile,
+                                       &POC[numpocs].resno0, &POC[numpocs].compno0,
+                                       &POC[numpocs].layno1, &POC[numpocs].resno1,
+                                       &POC[numpocs].compno1, POC[numpocs].progorder) == 7) {
+                                       POC[numpocs].prg1 = give_progression(POC[numpocs].progorder);
+                                       numpocs++;
+                                       while (*s && *s != '/') {
+                                               s++;
+                                       }
+                                       if (!*s) {
+                                               break;
+                                       }
+                                       s++;
+                               }
+                               j2k_parameters->numpocs = numpocs;
+                       }
+                       break;
       /* ------------------------------------------------------ */
     case 'S':                  /* SOP marker */
-      CSty |= 0x02;
+      j2k_parameters->csty |= 0x02;
       break;
       /* ------------------------------------------------------ */
     case 'E':                  /* EPH marker */
-      CSty |= 0x04;
+      j2k_parameters->csty |= 0x04;
       break;
       /* ------------------------------------------------------ */
     case 'M':                  /* Mode switch pas tous au point !! */
       if (sscanf(optarg, "%d", &value) == 1) {
-       for (i = 0; i <= 5; i++) {
-         int cache = value & (1 << i);
-         if (cache)
-           mode |= (1 << i);
-       }
+                               for (i = 0; i <= 5; i++) {
+                                       int cache = value & (1 << i);
+                                       if (cache)
+                                               j2k_parameters->mode |= (1 << i);
+                               }
       }
       break;
       /* ------------------------------------------------------ */
     case 'R':                  /* ROI */
-      if (sscanf(optarg, "OI:c=%d,U=%d", &ROI_compno, &ROI_shift) != 2) {
-       fprintf(stderr, "ROI error !! [-ROI:c='compno',U='shift']\n");
-       return 1;
-      }
-      break;
+      {
+                               if (sscanf(optarg, "OI:c=%d,U=%d", &j2k_parameters->roi_compno,
+                                           &j2k_parameters->roi_shift) != 2) {
+                                       fprintf(stderr, "ROI error !! [-ROI:c='compno',U='shift']\n");
+                                       return 1;
+                               }
+                       }
+                       break;
       /* ------------------------------------------------------ */
     case 'T':                  /* Tile offset */
-      if (sscanf(optarg, "%d,%d", &TX0, &TY0) != 2) {
-       fprintf(stderr, "-T 'tile offset' argument error !! [-T X0,Y0]");
-       return 1;
-      }
-      break;
+                       {
+                               if (sscanf(optarg, "%d,%d", &j2k_parameters->cp_tx0, &j2k_parameters->cp_ty0) != 2) {
+                                       fprintf(stderr, "-T 'tile offset' argument error !! [-T X0,Y0]");
+                                       return 1;
+                               }
+                       }
+                       break;
       /* ------------------------------------------------------ */
     case 'C':                  /* Add a comment */
-      cp.comment = optarg;
-      break;
+                       {
+                               j2k_parameters->cp_comment = (char*)malloc(strlen(optarg) + 1);
+                               if(j2k_parameters->cp_comment) {
+                                       strcpy(j2k_parameters->cp_comment, optarg);
+                               }
+                       }
+                       break;
       /* ------------------------------------------------------ */
     case 'I':                  /* reversible or not */
-      ir = 1;
-      break;
+                       {
+                               j2k_parameters->irreversible = 1;
+                       }
+                       break;
       /* ------------------------------------------------------ */
     case 'W':                  /* Width and Height and Cb and Cr subsampling in case of YUV format files */
       if (sscanf
-         (optarg, "%d,%d,%d,%d", &w, &h, &CbCr_subsampling_dx,
-          &CbCr_subsampling_dy) != 4) {
-       fprintf(stderr, "-W argument error");
-       return 1;
+                               (optarg, "%d,%d,%d,%d", &mj2_parameters.w, &mj2_parameters.h, &mj2_parameters.CbCr_subsampling_dx,
+                               &mj2_parameters.CbCr_subsampling_dy) != 4) {
+                               fprintf(stderr, "-W argument error");
+                               return 1;
       }
       break;
       /* ------------------------------------------------------ */
     case 'F':                  /* Video frame rate */
-      if (sscanf(optarg, "%d", &frame_rate) != 1) {
-       fprintf(stderr, "-f argument error");
-       return 1;
+      if (sscanf(optarg, "%d", &mj2_parameters.frame_rate) != 1) {
+                               fprintf(stderr, "-F argument error");
+                               return 1;
       }
       break;
       /* ------------------------------------------------------ */
@@ -613,211 +606,201 @@ int main(int argc, char **argv)
       return 1;
     }
   }
-
-  cp.tx0 = TX0;
-  cp.ty0 = TY0;
-
+    
   /* Error messages */
   /* -------------- */
-  if (!infile || !outfile) {
+       if (!mj2_parameters.cod_format || !mj2_parameters.decod_format) {
     fprintf(stderr,
-           "usage: frames_to_mj2 -i yuv-file -o mj2-file (+ options)\n");
+      "Usage: %s -i yuv-file -o mj2-file (+ options)\n",argv[0]);
     return 1;
   }
+  
+       if ((j2k_parameters->cp_disto_alloc || j2k_parameters->cp_fixed_alloc || j2k_parameters->cp_fixed_quality)
+               && (!(j2k_parameters->cp_disto_alloc ^ j2k_parameters->cp_fixed_alloc ^ j2k_parameters->cp_fixed_quality))) {
+               fprintf(stderr, "Error: options -r -q and -f cannot be used together !!\n");
+               return 1;
+       }                               /* mod fixed_quality */
+
+       /* if no rate entered, lossless by default */
+       if (j2k_parameters->tcp_numlayers == 0) {
+               j2k_parameters->tcp_rates[0] = 0;       /* MOD antonin : losslessbug */
+               j2k_parameters->tcp_numlayers++;
+               j2k_parameters->cp_disto_alloc = 1;
+       }
 
-  if ((cp.disto_alloc || cp.fixed_alloc || cp.fixed_quality)
-      && (!(cp.disto_alloc ^ cp.fixed_alloc ^ cp.fixed_quality))) {
-    fprintf(stderr,
-           "Error: options -r -q and -f can not be used together !!\n");
-    return 1;
-  }                            // mod fixed_quality
-
-  /* if no rate entered, lossless by default */
-  if (tcp_init->numlayers == 0) {
-    tcp_init->rates[tcp_init->numlayers] = 0;   //MOD antonin : losslessbug
-    tcp_init->numlayers++;
-    cp.disto_alloc = 1;
-  }
+       if((j2k_parameters->cp_tx0 > j2k_parameters->image_offset_x0) || (j2k_parameters->cp_ty0 > j2k_parameters->image_offset_y0)) {
+               fprintf(stderr,
+                       "Error: Tile offset dimension is unnappropriate --> TX0(%d)<=IMG_X0(%d) TYO(%d)<=IMG_Y0(%d) \n",
+                       j2k_parameters->cp_tx0, j2k_parameters->image_offset_x0, j2k_parameters->cp_ty0, j2k_parameters->image_offset_y0);
+               return 1;
+       }
 
-  if (TX0 > Dim[0] || TY0 > Dim[1]) {
+       for (i = 0; i < j2k_parameters->numpocs; i++) {
+               if (j2k_parameters->POC[i].prg == -1) {
+                       fprintf(stderr,
+                               "Unrecognized progression order in option -P (POC n %d) [LRCP, RLCP, RPCL, PCRL, CPRL] !!\n",
+                               i + 1);
+               }
+       }
+  
+  if (j2k_parameters->cp_tdx > mj2_parameters.Dim[0] || j2k_parameters->cp_tdy > mj2_parameters.Dim[1]) {
     fprintf(stderr,
-           "Error: Tile offset dimension is unnappropriate --> TX0(%d)<=IMG_X0(%d) TYO(%d)<=IMG_Y0(%d) \n",
-           TX0, Dim[0], TY0, Dim[1]);
+      "Error: Tile offset dimension is unnappropriate --> TX0(%d)<=IMG_X0(%d) TYO(%d)<=IMG_Y0(%d) \n",
+      j2k_parameters->cp_tdx, mj2_parameters.Dim[0], j2k_parameters->cp_tdy, mj2_parameters.Dim[1]);
     return 1;
   }
-
-  for (i = 0; i < numpocs; i++) {
-    if (POC[i].prg == -1) {
-      fprintf(stderr,
-             "Unrecognized progression order in option -P (POC n %d) [LRCP, RLCP, RPCL, PCRL, CPRL] !!\n",
-             i + 1);
-    }
-  }
-
+    
   /* to respect profile - 0 */
   /* ---------------------- */
-  numD_min = 0;
-
-  x1 = !Dim[0] ? (w - 1) * subsampling_dx + 1 : Dim[0] + (w -
-                                                         1) *
-    subsampling_dx + 1;
-  y1 = !Dim[1] ? (h - 1) * subsampling_dy + 1 : Dim[1] + (h -
-                                                         1) *
-    subsampling_dy + 1;
-
-  if (Tile_arg == 1) {
-    cp.tw = int_ceildiv(x1 - cp.tx0, cp.tdx);
-    cp.th = int_ceildiv(y1 - cp.ty0, cp.tdy);
-  } else {
-    cp.tdx = x1 - cp.tx0;
-    cp.tdy = y1 - cp.ty0;
+  
+  x1 = !mj2_parameters.Dim[0] ? (mj2_parameters.w - 1) * j2k_parameters->subsampling_dx 
+               + 1 : mj2_parameters.Dim[0] + (mj2_parameters.w - 1) * j2k_parameters->subsampling_dx + 1;
+  y1 = !mj2_parameters.Dim[1] ? (mj2_parameters.h - 1) * j2k_parameters->subsampling_dy 
+               + 1 : mj2_parameters.Dim[1] + (mj2_parameters.h - 1) * j2k_parameters->subsampling_dy + 1;   
+  mj2_parameters.numcomps = 3;                 /* Because YUV files only have 3 components */ 
+  mj2_parameters.prec = 8;                     /* Because in YUV files, components have 8-bit depth */
+
+       j2k_parameters->tcp_mct = 0;
+    
+  mj2file = fopen(mj2_parameters.outfile, "wb");
+  
+  if (!mj2file) {
+    fprintf(stderr, "failed to open %s for writing\n", argv[2]);
+    return 1;
   }
-
-
-  /* Initialization for PPM marker */
-  cp.ppm = 0;
-  cp.ppm_data = NULL;
-  cp.ppm_previous = 0;
-  cp.ppm_store = 0;
-
-  numcomps = 3;                        /* Because YUV files only have 3 components */
-
-  tcp_init->mct = 0;           /* No component transform needed */
-
-  prec = 8;                    /* Because in YUV files, components have 8-bit depth */
-
-  /* Init the mutiple tiles */
-  /* ---------------------- */
-  cp.tcps = (j2k_tcp_t *) malloc(cp.tw * cp.th * sizeof(j2k_tcp_t));
-
-  for (tileno = 0; tileno < cp.tw * cp.th; tileno++) {
-    tcp = &cp.tcps[tileno];
-    tcp->numlayers = tcp_init->numlayers;
-    for (j = 0; j < tcp->numlayers; j++) {
-      if (cp.fixed_quality)    // add fixed_quality
-       tcp->distoratio[j] = tcp_init->distoratio[j];
-      else
-       tcp->rates[j] = tcp_init->rates[j];
-    }
-    tcp->csty = CSty;
-    tcp->prg = Prog_order;
-    tcp->mct = tcp_init->mct;
-    tcp->ppt = 0;
-    tcp->ppt_data = NULL;
-    tcp->ppt_store = 0;
-
-    numpocs_tile = 0;
-    tcp->POC = 0;
-    if (numpocs) {
-      /* intialisation of POC */
-      tcp->POC = 1;
-      for (i = 0; i < numpocs; i++) {
-       if (tileno == POC[i].tile - 1 || POC[i].tile == -1) {
-         tcp_poc = &tcp->pocs[numpocs_tile];
-         tcp_poc->resno0 = POC[numpocs_tile].resno0;
-         tcp_poc->compno0 = POC[numpocs_tile].compno0;
-         tcp_poc->layno1 = POC[numpocs_tile].layno1;
-         tcp_poc->resno1 = POC[numpocs_tile].resno1;
-         tcp_poc->compno1 = POC[numpocs_tile].compno1;
-         tcp_poc->prg = POC[numpocs_tile].prg;
-         tcp_poc->tile = POC[numpocs_tile].tile;
-         numpocs_tile++;
-       }
-      }
-    }
-    tcp->numpocs = numpocs_tile;
-    tcp->tccps = (j2k_tccp_t *) malloc(numcomps * sizeof(j2k_tccp_t));
-
-    for (i = 0; i < numcomps; i++) {
-      tccp = &tcp->tccps[i];
-      tccp->csty = CSty & 0x01;        /* 0 => one precinct || 1 => custom precinct  */
-      tccp->numresolutions = NumResolution;
-      tccp->cblkw = int_floorlog2(cblockw_init);
-      tccp->cblkh = int_floorlog2(cblockh_init);
-      tccp->cblksty = mode;
-      tccp->qmfbid = ir ? 0 : 1;
-      tccp->qntsty = ir ? J2K_CCP_QNTSTY_SEQNT : J2K_CCP_QNTSTY_NOQNT;
-      tccp->numgbits = 2;
-      if (i == ROI_compno)
-       tccp->roishift = ROI_shift;
-      else
-       tccp->roishift = 0;
-      if (CSty & J2K_CCP_CSTY_PRT) {
-       int p = 0;
-       for (j = tccp->numresolutions - 1; j >= 0; j--) {
-         if (p < res_spec) {
-           if (prcw_init[p] < 1)
-             tccp->prcw[j] = 1;
-           else
-             tccp->prcw[j] = int_floorlog2(prcw_init[p]);
-
-           if (prch_init[p] < 1)
-             tccp->prch[j] = 1;
-           else
-             tccp->prch[j] = int_floorlog2(prch_init[p]);
-         } else {
-           int size_prcw, size_prch;
-           size_prcw = prcw_init[res_spec - 1] >> (p - (res_spec - 1));
-           size_prch = prch_init[res_spec - 1] >> (p - (res_spec - 1));
-           if (size_prcw < 1)
-             tccp->prcw[j] = 1;
-           else
-             tccp->prcw[j] = int_floorlog2(size_prcw);
-           if (size_prch < 1)
-             tccp->prch[j] = 1;
-           else
-             tccp->prch[j] = int_floorlog2(size_prch);
-         }
-         p++;
-         /*printf("\nsize precinct pour level %d : %d,%d\n", j,
-            tccp->prcw[j], tccp->prch[j]); */
-       }
-      } else {
-       for (j = 0; j < tccp->numresolutions; j++) {
-         tccp->prcw[j] = 15;
-         tccp->prch[j] = 15;
-       }
-      }
-      calc_explicit_stepsizes(tccp, prec);
-    }
+    
+       /* get a MJ2 decompressor handle */
+       cinfo = mj2_create_compress();
+       movie = (opj_mj2_t*)cinfo->mj2_handle;
+       
+       /* catch events using our callbacks and give a local context */
+       opj_set_event_mgr((opj_common_ptr)cinfo, &event_mgr, stderr);
+
+       /* setup encoder parameters */
+       mj2_setup_encoder(movie, &mj2_parameters);   
+  
+  movie->tk[0].num_samples = yuv_num_frames(&movie->tk[0],mj2_parameters.infile); 
+  if (movie->tk[0].num_samples == -1) {
+               return 1;
   }
-
-  movie.tk = (mj2_tk_t *) malloc(sizeof(mj2_tk_t));
-  movie.num_vtk = 1;
-  movie.num_stk = 0;
-  movie.num_htk = 0;
-
-  movie.tk[0].imagefile = infile;
-  movie.tk[0].track_type = 0;  // Video Track
-  movie.tk[0].track_ID = 1;
-  movie.mj2file = outfile;
-  movie.tk[0].subsampling_dx = subsampling_dx;
-  movie.tk[0].subsampling_dy = subsampling_dy;
-  movie.tk[0].Dim[0] = Dim[0];
-  movie.tk[0].Dim[1] = Dim[1];
-  movie.tk[0].w = w;
-  movie.tk[0].h = h;
-  movie.tk[0].CbCr_subsampling_dx = CbCr_subsampling_dx;
-  movie.tk[0].CbCr_subsampling_dy = CbCr_subsampling_dy;
-  movie.tk[0].sample_rate = frame_rate;
-
-  if (mj2_init_stdmovie(&movie)) {
+  
+  // One sample per chunk
+  movie->tk[0].chunk = (mj2_chunk_t*) malloc(movie->tk[0].num_samples * sizeof(mj2_chunk_t));     
+  movie->tk[0].sample = (mj2_sample_t*) malloc(movie->tk[0].num_samples * sizeof(mj2_sample_t));
+  
+  if (mj2_init_stdmovie(movie)) {
     fprintf(stderr, "Error with movie initialization");
     return 1;
-  };
-  if (mj2_encode(&movie, &cp, index)) {
-    fprintf(stderr, "Error encoding movie");
-    return 1;
-  };
-  mj2_memory_free(&movie);
+  };    
+  
+  // Writing JP, FTYP and MDAT boxes 
+  buf = (unsigned char*) malloc (300 * sizeof(unsigned char)); // Assuming that the JP and FTYP
+  // boxes won't be longer than 300 bytes
+       cio = opj_cio_open((opj_common_ptr)movie->cinfo, buf, 300);
+  mj2_write_jp(cio);
+  mj2_write_ftyp(movie, cio);
+  mdat_initpos = cio_tell(cio);
+  cio_skip(cio, 4);
+  cio_write(cio, MJ2_MDAT, 4); 
+  fwrite(buf,cio_tell(cio),1,mj2file);
+  offset = cio_tell(cio);
+  opj_cio_close(cio);
+  free(buf);
+
+  for (i = 0; i < movie->num_stk + movie->num_htk + movie->num_vtk; i++) {
+    if (movie->tk[i].track_type != 0) {
+      fprintf(stderr, "Unable to write sound or hint tracks\n");
+    } else {
+      mj2_tk_t *tk;
+                       int buflen = 0;
+      
+      tk = &movie->tk[i];     
+      tk->num_chunks = tk->num_samples;
+                       numframes = tk->num_samples;
+
+      fprintf(stderr, "Video Track number %d\n", i + 1);
+                       
+                       img = mj2_image_create(tk, j2k_parameters);          
+                       buflen = 2 * (tk->w * tk->h * 8);
+                       buf = (unsigned char *) malloc(buflen*sizeof(unsigned char));   
+
+      for (sampleno = 0; sampleno < numframes; sampleno++) {           
+                               double init_time = opj_clock();
+                               double elapsed_time;
+                               if (yuvtoimage(tk, img, sampleno, j2k_parameters, mj2_parameters.infile)) {
+                                       fprintf(stderr, "Error with frame number %d in YUV file\n", sampleno);
+                                       return 1;
+                               }
+
+                               /* setup the encoder parameters using the current image and user parameters */
+                               opj_setup_encoder(cinfo, j2k_parameters, img);
+
+                               cio = opj_cio_open((opj_common_ptr)movie->cinfo, buf, buflen);
+                                                               
+                               cio_skip(cio, 4);
+                               cio_write(cio, JP2_JP2C, 4);    // JP2C
+
+                               /* encode the image */
+                               bSuccess = opj_encode(cinfo, cio, img, NULL);
+                               if (!bSuccess) {
+                                       opj_cio_close(cio);
+                                       fprintf(stderr, "failed to encode image\n");
+                                       return 1;
+                               }
+
+                               len = cio_tell(cio) - 8;
+                               cio_seek(cio, 0);
+                               cio_write(cio, len+8,4);
+                               opj_cio_close(cio);
+                               tk->sample[sampleno].sample_size = len+8;                               
+                               tk->sample[sampleno].offset = offset;
+                               tk->chunk[sampleno].offset = offset;    // There is one sample per chunk 
+                               fwrite(buf, 1, len+8, mj2file);                         
+                               offset += len+8;                                
+                               elapsed_time = opj_clock()-init_time;
+                               fprintf(stderr, "Frame number %d/%d encoded in %.2f mseconds\n", sampleno + 1, numframes, elapsed_time*1000);
+                               total_time += elapsed_time;
 
-  /* Free cp memory */
-  free(cp_init.tcps);
-  if (tcp_init->numlayers > 9)
-    free(cp.matrice);
-  for (tileno = 0; tileno < cp.tw * cp.th; tileno++)
-    free(cp.tcps[tileno].tccps);
-  free(cp.tcps);
+      }
+                       /* free buffer data */
+                       free(buf);
+                       /* free image data */
+                       opj_image_destroy(img);
+    }
+  }
+  
+  fseek(mj2file, mdat_initpos, SEEK_SET);
+       
+  buf = (unsigned char*) malloc(4*sizeof(unsigned char));
+
+       // Init a cio to write box length variable in a little endian way 
+       cio = opj_cio_open(NULL, buf, 4);
+  cio_write(cio, offset - mdat_initpos, 4);
+  fwrite(buf, 4, 1, mj2file);
+  fseek(mj2file,0,SEEK_END);
+  free(buf);
+
+  // Writing MOOV box 
+       buf = (unsigned char*) malloc ((TEMP_BUF+numframes*20) * sizeof(unsigned char));
+       cio = opj_cio_open(movie->cinfo, buf, (TEMP_BUF+numframes*20));
+       mj2_write_moov(movie, cio);
+  fwrite(buf,cio_tell(cio),1,mj2file);
+  free(buf);
+
+       fprintf(stdout,"Total encoding time: %.2f s for %d frames (%.1f fps)\n", total_time, numframes, (float)numframes/total_time);
+  
+  // Ending program 
+  
+  fclose(mj2file);
+       /* free remaining compression structures */
+       mj2_destroy_compress(movie);
+       free(cinfo);
+       /* free user parameters structure */
+  if(j2k_parameters->cp_comment) free(j2k_parameters->cp_comment);
+       if(j2k_parameters->cp_matrice) free(j2k_parameters->cp_matrice);
+       opj_cio_close(cio);
 
   return 0;
 }
+
+