[trunk] Another round of fixes for sign conversion warnings.
Update issue 256

[trunk] Another round of fixes for sign conversion warnings.
Update issue 256

[trunk] Another round of fixes for sign conversion warnings.
Update issue 256

[trunk] Another round of fixes for sign conversion warnings.
Update issue 256

[trunk] As reported by clang analyzer thoses values were never read

[trunk] Remove mem leak and warning reported by clang

[trunk] Remove simple warnings about format

[trunk] Remove simple warning about functions not used

[trunk] Another round of fixes for sign conversion warnings.
Update issue 256

[trunk] Another round of fixes for sign conversion warnings.
Update issue 256

[trunk] Fix simple warning about sign conversion
Update issue 256

[trunk] Another of fixes for warning about sign conversion
Update issue 256

[trunk] Fix warning about sign conversion
Update issue 256

[trunk] un-deprecated opj_stream_destroy API, import patch manually
In some case user still want to be able to call opj_stream_destroy.
Fixes issue 227

[trunk] Update memory management mecanism
Fixes issue 253

[trunk] Remove self-assignement.
Fixes issue 273

[trunk] Fix compilation in visual studio, inline cannot be used directly.
Fixes issue 272

[trunk] Remove warning about implicitly defined function

[trunk] Remove TIFF warning handler. This help test suite run smoothly on windows by removing the message box.
Fixes issue 276

[trunk] Fix mem leaks reported by cppcheck

[trunk] Simplify code and remove bogus out of bound check

[trunk] Revert r2597 for now, since it breaks a lot of tests

[trunk] Remove warning about sign conversion.
Update issue 256

[trunk] Remove some easy warnings

[trunk] Remove warning about sign conversion.
Update issue 256

[trunk] Remove warning about sign conversion.
Update issue 256

[trunk] Remove warning about sign conversion.
Update issue 256

[trunk] Remove warning about sign conversion.
Update issue 256

[trunk] Remove warning about sign conversion.
Update issue 256

[trunk] Remove some easy warnings about sign compare reported by gcc

[trunk] Remove out of bound access in code and simplify code. this is a test tool, security is not an issue here.

[trunk] Remove simple warning about unused variables

[trunk] Make sure that all output files from the test suite are using a different output name
Fixes issue 271

[trunk] Handle cmap where direct use is specified (issue235_cmapsubbox.jp2)
I doubt the old code ever work. The new code copy the old codestream bytes into the new components (instead of copying the pointer).
Technically the issue235.jp2 file should be handled since I.5.3.5 specifies that:
...
If the JP2 Header box does not contain a Component Mapping box, the components shall be mapped directly to channels,
such that component i is mapped to channel i.
...
Update issue 235

[trunk] Make sure to reject images such as 1336.pdf.asan.47.376.jp2
Fixes issue 267

[trunk] remove more conversion warning in multi-lines macro.
C allow simple tricks such as to find those:
gcc -E tcd.c | sed '/^\#/d' | indent -st -i2 > clean.c
Update issue 256

[trunk] Remove some conversion warnings reported by gcc
Update issue 256

[trunk] Remove another warning. ftell returns long int
Update issue 256

[trunk] Remove more conversion warnings.
Update issue 256

[trunk] Remove warning about conversion.
Update issue 256

[trunk] Add a TIFF compare function (PEAK/MSE)
Fixes issue 100

[trunk] Revert portion of r2562, need to investigate issue.
Update issue 269

[trunk] Remove remaining conversion issues in mqc.c

[trunk] Remove remainings conversion issues in t2.c + clock.c

[trunk] Remove a simple warning about int -> float conversion

[trunk] rework code to avoid a warning. this also remove a division and prefer bit-shift

[trunk] Remove some more warnings about conversion

[trunk] Prefer compile time constant to avoid conversion double -> int

[trunk] Review warning about types conversion, and add cast when needed

[trunk] Remove some simple warnings about conversion

[trunk] fgets takes an int as parameter

[trunk] Remove warning about cast double -> int. Instead use bit-shifting (compile time computation)

[trunk] Remove easy to fix warnings about conversion

[trunk] Import left over from patch submitted as issue 225 (comment #14)
Update issue 225

[trunk] remove some simple warnings about unused params

[trunk] remove all api with invalid FILE* parameters which could leads to issues when applications are compiled with different flags from openjpeg.
Fixes issue 198

[trunk] Explicitely trigger issue 229, there may be an impact in code execution. The assert may get removed afterward
Update issue 229

[trunk] Remove simple warnings

[trunk] Remove 3635.pdf.asan.77.2930.jp2 from opj_dump tests
Update issue 250

[trunk] Avoid conflicting declarion for fseek in openjp2 vs fseek in openjpip

[trunk] Fix md5 values for decode-md5 tests.
Update issue 250

[trunk] Remove deprecated functions.
Update issue 268

[trunk] Remove warning about unused function
Update issue 268

[trunk] Remove deprecated functions (not called anywhere in the code base).
Update issue 268

[trunk] Remove unused variables from test

[trunk] Remove some simple warnings about var being set but not used

[trunk] Remove warning about -2147483648 (aka INT_MIN), causing this decimal constant is unsigned only in ISO C90

[trunk] Remove simple warnings about comments, missing case in switch statement

[trunk] Fix compilation on MSVC compiler

[trunk] Partially rework r2506, original patch from issue 171 was totally bogus (untested?) and did break most of the test (eg. p1_04 family)
convert.c duplicate a lot of code, this patch only adresses the PGX codec section of the code.
Update issue 171
Update issue 264

[trunk] Make sure to run *-decode-md5 only after *-decode tests. Update md5 since recent code change.

[trunk] Remove easy uint32 <-> int32 conversions

[trunk] Re-import chunk from r2458 that made textGBR.jp2 to fail otherwise
Update issue 225

[trunk] Rework r2458, instead we should reject 451.pdf.SIGSEGV.ce9.3723 since tile-parts are out of order (as per kakadu behavior).
Update issue 225

[trunk] Mark a file as being invalid for opj_dump

[trunk] Fix JPIP test with updated md5sum

[trunk] Really apply r2460 this time, but fix the original typo in the submitted patch
Update issue 225

[trunk] final round of minor cleanups

[trunk] Remove PNG generation code for now

[trunk] Prefer strcpy since it copies trailing 0 directly

[trunk] Simplify code to centralize code cleanup

[trunk] Some code cleanup add sentinels

[trunk] Remove a simple warning, and use static to detect unused functions. Simplify function declarations.

[trunk] run test suite on dataset from issue 171
Fixes issue 171

[trunk] Remove some simple warnings in opj_dump

[trunk] Merge final patch from issue 171 with code simplification. also handles signed case properly.
Fixes issue 171

[trunk] Fix find_path behavior within cross-compilation execution

[trunk] Import patch from issue 218. No dataset to check, so blindly applied it.
Fixes issue 218

[trunk] Import patch from issue 171. Only the imagetoraw part was not applied.
Update issue 171

[trunk] Try to run test suite on invalid dataset from sumatrapdf team
Update issue 225

[trunk] run test suite to illustrate patch from r2458

[trunk] Make sure that opj_decompress only output a single component
Update issue 110

[trunk] add issue 46 to the test suite
Fixes issue 46

[trunk] improve command line parser syntax checking

[trunk] add a sentinel in debug code

[trunk] simplify code using for loop

[trunk] Import test case from issue 208. This appears to be fixed now.
Fixes issue 208

[trunk] Run test suite on dataset from issue 211. Test is now passing nicely.
Fixes issue 211

[trunk] run test suite on dataset from issue 135. Add fake md5sum to make sure tests is failing.
Update issue 135

[trunk] Update missing md5sums