[trunk] remove some unused variable from opj_config and rename other one with opj_ prefix

[trunk] split into two config files config options related to the lib and to the application.

[trunk] add the prefix opj_ to deprecated everywhere

[trunk] update documentation of new functions _v3 and mark deprecated related functions

[trunk] move to the new API for function opj_stream_create_default_file_stream. Use now opj_stream_create_default_file_stream_v3 (WIP)

[trunk] move to the new API for function opj_stream_destroy. Use now opj_stream_destroy_v3 (WIP)

[trunk] rename deprecated macro with opj_ prefix and use it for opj_stream_destroy function

[trunk] add functions to avoid to use FILE* into the API (thanks winfried).
Update issue 120 and update issue 198

[trunk] add a test related to issue 202

[trunk] update convert about png writing with additional metadata (thanks winfried)

[trunk] update test suite for issue 5 and 62

[trunk] backout one part of the rev 2266

[trunk] JP3D: Fix issue with Z handling in packet iterator

[trunk] JP3D: Handles errors properly

[trunk] JP3D: remove old debug

[trunk] JP3D: convert from DOS to UNIX eol

[trunk] JP3D: remove exe bit from source files

[trunk] merge from branch 1.5 a correction about large code-block data (decoding part) and add tests about issue 5 and issue 62

[trunk] remove left over from v2 transition

[trunk] JP3D: completely redo the opj_tgt_create function. Take as input the initial opj_tgt_create as found in openjpeg 1.5, and extend with the 3rd dimension.

Doxyfile: HTML_TIMESTAMP = NO

helps when comparing the output of multiple runs,
and distros will appreciate avoiding multilib conflicts.

[trunk] correct the new name of OPJ_HAVE_STDINT_H everywhere

[trunk] remove SSIZE which is unused in openjpeg and rename HAVE_STDINT_H to OPJ_HAVE_STDINT_H

[trunk] add openjpeg.h in some files of openjpip to use some opj type (thanks winfried)

[trunk] move typedef from opj_stdint.h to openjpeg.h and add an include of stdio.h in openjpeg.h. Fixes issue 197

[trunk] correct the encoding of colr box information (thanks Winfried)

[trunk]add the pkgconfig support for openjp2 (thanks Winfried)

[trunk] JP3D codec was trying to pull information from the registration parameter in COM. This is non-standard.

[trunk] As per T.809 code block are not shifted in JP3D

Table A.7
3D code-block width, height and depth exponent values xcb = value, ycb = value
or zcb = value.
NOTE – This redefines Rec. ITU-T T.800 | ISO/IEC 15444-1 significantly! The 3D
code-block width, height and depth are limited to powers of two with the minimum
size being 20 and the maximum being 210.
Further, the 3D code-block size is restricted so that 4 ≤ xcb+ycb+zcb ≤ 18.

[trunk] JP3D: this is safe to write comment using Registration: ISO-8859-15

[trunk] JP3D fix issue with Registration value in COM marker. Move COM marker just before COD.

[trunk] jp3d: fix command line parsing for subsampling

[trunk] Fix issue with ITU-T T.809 (05/2011)

- ZSI is now known as NSI (FF54)
- NSI now stores Ndim (=3)
- CAP extended marker was not set properly

[trunk] Fix compilation issue where size_t would be undefined

[test] update the list of files which will be gracefully rejected when they are dump

[trunk] add empty test about the issue 197. Updates issue 197

[trun[trunk] check if the dx and dy steps are not incorrect according to the JPEG2000 norm (thanks Even).
Test associated to this issue should nicely fail. Fixes issue 194

[trunk] check if the number of tiles is not incorrect regarding the JPEG2000 norm (thanks Even).
Test associated to this issue should nicely fail. Fixes issue 163

[trunk] test about issue 192 should nicely fail

[trunk] check the index of the component in read_qcc (thanks Even). fixes issue 192

[trunk] update test suite with issue 191 to 194 and update patch for 191 which should fail properly

[trunk] fix issue 191 (thanks Even)

[trunk]remove not used structures

[trunk] remove the extended struct it is a bad idea

[trunk] add extended capacities for future development

[trunk] rename USE_LEGACY into OPJ_USE_LEGACY for consistency with other #define

[trunk] Attempt to fix compilation error with mj2

[trunk] Attempt to fix compilation error with mj2

[trunk] solve the problem with new opj_ symbols in color.c

[trunk] add opj_ prefix to some internal define and use the new opj type instead of int and float in some files

[trunk]rename the cinema option to old one

[trunk] update some applications with new OPJ_BOOL type

[trunk] use OPJ_INT32 instead of int in t2.c

[trunk] rename function with the new opj_ prefix

[trunk] solve a potential bug when we test the realloc

[trunk] add an assert to spot a problem. update issue 189

[trunk]update the copyright, the authors and thanks to respect the license

[trunk] propagate the new OPJ_ symbol and type to openjpip

[trunk]rename decompress options with the goog name

runk] fix the documentation of the API

[trunk] avoid memory leak in j2k_random_tile_access.c

[trunk]extend last commits to apps

[trunk] move opj_bool to OPJ_BOOL to follow the other type

[trunk]remove OPJ_LIMIT_DECODING struct which is not useful for v2 API

[trunk] rename public symbols with OPJ_ prefix (enum part)

[trunk] rename public symbols with OPJ_ prefix

[trunk] remove warnings raised by flags -Wall -Wextra -pedantic

[trunk] remove warnings raised by vs11-beta analyzer

[trunk] remove warnings raised by flags -Wall -Wextra -pedantic

[trunk] remove warnings raised by flags -Wall -Wextra -pedantic and vs9 analyzer

[trunk] remove warnings raised by flags -Wall -Wextra -pedantic

[trunk] manage the case where the SOT marker is alone, PSot=12 (case of PHR data).
Fixes  issue 162

[trunk] avoid memory leak in opj_t2_decode_packets

[trunk] add some new tests related to new data; indicate that some tests should failed because data are wrong

[trunk] Add more testing to the tile access/random

Update issue 186

[trunk] Fix what looks like a copy/paste error

Update issue 186

[trunk] Add more test in j2k_random_tile_access

Update issue 186

[trunk] Add new tests (j2k_random_tile_access)

[trunk] remove old structure from testempty

[trunk] add documentation

[trunk]OPJ_STREAM_READ is now equal to OPJ_TRUE and OPJ_STREAM_WRITE to OPJ_FALSE

[trunk] move opj_event_mgr struct from openjpeg. h to event.h

[trunk] remove old struct from V1 and not used in V2

[trunk] Remove bool.h, use opj_bool instead

Fix remaining opj_calloc/malloc/free issues

[trunk] Fix simple warning about unused variables

[trunk] Make sure to use off_t

[trunk] Remove temp fix now that mj2 is fixed

[trunk] Update version number to 2.0. This will help for testing generating scripts

[trunk] Fix remainings issues with doxygen doc

Convert DOS files to UNIX eol

[trunk] Normalize the return type of opj_read_from_file regarding the test in the calling function

[trunk] Remove some simple warnings about missing prototypes

[trunk] Fix compilation when JPIP is OFF

[trunk] Merge back JPIP modification into v2

This commit imports changes from openjpip.c from r2122 into openjpeg.c

[trunk] remove warnings related to the use of -Wall -Wextra -pedantic

[trunk] finish to remove the old cio_ struct (last comment is incomplete)

[trunk] remove some warnings from -Wall -Wextra -pedantic

[trunk]remove some warnings raised by Wall

[trunk] use the right cp structure in image.h

[trunk] remove last warnings from t1

[trunk] rename t1_getwmsedec_v2 to opj_t1_getwmsedec and remove t1_getwmsedec