Integrate some more diffs from the 1.5 branch

Start merging of the 1.5 branch into trunk. Start with doc

add opj_logo.icns for trunk and 1.5

Fix test NR-ENC-Bretagne2.ppm-4-encode on linux.

Fix strange line, as reported by lockalsash (gmail.com)

minor typo

[trunk] remove some warnings detected by cppcheck

Add new mechanism for cppcheck

Update changelog

Apply patch from Brad Hards to fix some typos.

Apply doxygen fixes suggested by Brad Hards on opj mailing list.

Sorry. Reverting mistake.

Simplify code. Use standard find_package call instead. ctest script will need to handle this now

Add CPack stuff

[trunk] fix a bug during the creation of the codestream index

[trunk] fix warnings when printing large integers

[trunk] fix a warning about a recent commit (1104)

[trunk] fix compilation of j2k_random_access on Visual C++

[trunk] make large file support variables persistent in CMake to allow reconfiguration

[trunk] fix call to opj_destroy_cstr_info_v2 in j2k_random_tile_access

[trunk] fix bug during random access to tile (tile already decoded)

[trunk] fix error about the way to detect the additional test suite

[trunk] implement Large File support in the library

[trunk] fix error with new way to detect kdu_expand

[trunk] add support for Large File in autoconf

[trunk] fix definition of _FILE_OFFSET_BITS macro on platform where it is needed

[trunk] add definitions for 64 bits integer types, and define OPJ_OFF_T to map to OPJ_INT64 systematically

[trunk] activate LargeFileSupport in CMake

[trunk] search for kdu_expand in a more cmake-compliant way

[trunk] clean up redundant includes already handled in opj_includes.h

[trunk] backout wrong changeset 1091 - see issue 123

[trunk] support seeking in files larger than 2 GB

Remove duplicate definition

Cleanup jpip cmake compilation

add note for cmake

Use cmake style define. Fix big endian issue on dual OS (eg. Tiger)

minor reindentation

Remove exe bit from source files

fix variable name to be hidden

Avoid message pollution during cmake configuration time

[trunk] WIP: fix bug with windows platform and j2k_dump

[trunk] WIP: fix bug with windows platform and j2k_to_image

[trunk] WIP: fix bug when decoding an area or a tile with special resolution

[trunk] WIP: enhance j2k_to_image with new get_decoded_tile functionality

[trunk] WIP: clean j2k_dump and enhance j2k_dump with commit 1052

[trunk] WIP: add a set decoded resolution factor function and update j2k_to_image help about decoded region

[trunk][JPIP] fixed opj_server execusion error (instant terminating) with autotool, cmake still need to be fixed

[trunk] fix tests/nonregresion/CMakeList.txt

[trunk] WIP: fix get_decoded_tile function to avoid error with output image

[trunk] fix bug with mj2 applications (credit to winfried)

[trunk] enhance mj2 when read jp2h (credit to winfried)

[trunk] check if the file extension is the same as the infile format (credit to winfried)

[trunk] add some sanity check in CMakeLists to prevent STRING(REGEX..) call issues

[trunk][JPIP] enabled OpenJPEG V2 API

[trunk] WIP: add get_decoded_tile functionality

[trunk] WIP: clean and enhance j2k files

[trunk] WIP: clean and enhance openjpeg.c

[trunk] WIP: clean and enhance openjpeg.h and add deprecated macro

[trunk][JPIP] updated main page of doxygen

solved memory leak of opj_server, and removed redundant defines

[trunk][JPIP] additional patches for autotools and cmake

additional patches for autotool are applied

fixed client viewer to be compatible with server response header both Content-type and Content-Type

patches for cmake and autotool are applied

[trunk] WIP: add a file to exclude some valgrind errors (detected with ctest_memcheck) related to png lib found with ubuntu10.04 platform

[trunk] WIP: solve problems with reading of elements outside the tilec->data buffer in dwt

[trunk] WIP: manage output image with area correponding to the set decoded area

[trunk] WIP: enhance codestream index generation

[trunk] WIP: isolate dump test suite

WIP: remove memory leak about new jp2_read_marker function

[trunk] WIP: remove previous commit about memory leak with ppm read function

[trunk] WIP: solve memory leak with ppm read function

start using API style in openJPIP library

[trunk] WIP: solve problem with writing of tga image from an image with signd=1 (credit to Winfried)

[trunk] WIP: solve some memory leak in test compare functions

adapt makefiles to the new structure

rearranged opj_server, opj_dec_server directory

enable all progression orders

include stdlib.h for calloc

[trunk] WIP: resolve heap corruption with p0_07.j2k (credit to Winfried)

[trunk] WIP: correct some memory leaks in applications functions

[trunk] WIP: add a read CBD marker function (JPEG2000 part 2)

[trunk] WIP: add a read MCO marker function (JPEG2000 part 2)

[trunk] WIP: add a read MCC marker function (JPEG2000 part 2)

[trunk] WIP: add a read MCT marker function (JPEG2000 part 2)

enable layers requests; restricting the number of codesream quality layers

[trunk] WIP: correct a segfault inside j2k_dump output

-J option for -jpip added into the option list

change -v option was renamed to -u, which is equivalent to -TP long option

[trunk] WIP: correct some segfault with win platform and remove a aligned allocation which produce error when a realloc is done on this pointer

[trunk]  WIP: add stream length value to read unknown marker size, backport 855 into V2 framework, correct memory leak into get_cstr_info

[trunk] WIP: add output elements about decoding of jp2 files with last tile part lenght equal zero

[trunk] WIP: correct mistake with JP2 files and manage correctly the text_GBR.jp2 filecase

change -v option was reactivated for JPIP

enable JPT-stream request from client viewer option

[trunk][JPIP]removed obsolete indexer utility

[trunk] fix name

[trunk] add libopenjpeg-jpwl.pc.in. fix output when --disable-shared or --disable-static is passed to configure. Minor clean up of configure.ac.

[trunk] fix 'distcheck' rule

[trunk] WIP: correct mistake in text output inside set_decoded_area function (credit to Winfried)